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注册12306显示身份证已被注册，意味着该身份证号码已经在中国铁路客户服务中心的系统中存在，即已经使用此身份证进行过注册。这种情况可能有以下几种原因。
1、可能是自己或者他人之前已经注册过账号。
2、身份信息可能被盗用。
如果是自己之前已经注册过，可以使用注册时设置的用户名（邮箱或手机号）和密码登录，如果忘记用户名或密码，可以通过找回密码的方式操作，如果是身份信息被盗用，建议尽快联系相关部门如铁路客服中心或公安机关，寻求帮助并解决问题，在这种情况下，可能需要提供一些证明文件来验证身份，也可以尝试联系12306网站上的客服人员，获取更多帮助和指导。
为了避免类似情况的发生，应妥善保管好自己的个人信息，防止泄露。